陈吉宁称，新《环保法》明确要落实地方政府的环境质量责任，但是制约的法律手段不足。
另一方面，新《环保法》有些条款在操作层面上执行困难。比如按日计罚效果非常明显，但是法律要求企业违法排污拒不改正的，才能启动按日计罚。“打个比方，如果你上公共汽车，抓到你没有票，得先补票。如果拒绝补票，才能够实行按日处罚。”
虽然新《环保法》对于未批先建问题规定了责令停止建设、恢复原状等措施，但对监管部门授权有限。监管部门缺乏有力的强制手段，难以及时制止该类违法行为。
而且新《环保法》规定未批先建可以适用拘留，但违法建成并已投产建设项目的责任人，却不在拘留的适用范围。
陈吉宁称，新《环保法》规定的部门职责，只有一半在环保部门手里。《大气污染防治法》规定的部门职责只有三分之一在环保部门手里。一些地方政府落实新《环保法》，分工不明确。这种不明确越到基层越模糊。“所以下一步要明晰各部门的责任，才能更好地落实《环保法》。”
陈吉宁表示，环境执法能力不足，也影响新《环保法》实施。特别是在区县级，环境监管的人员严重不足，装备老化等问题十分突出，很难适应日益繁重的监管任务。
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